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联合全世界闲置计算机研究新冠病毒!斯坦福推新项目

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澎湃新闻记者 王心馨

全世界闲置的计算机联合起来!日前,由斯坦福大学潘德实验室(Pande Lab)主持的Folding@home分布式计算项目,正式向全世界发出邀请,寻找志愿者利用家里闲置的计算机,帮助研究人员开发新型冠状病毒的治疗方法。


Folding@home(简称FAH)成立于2000年10月1日,是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程,也是当前世界上最大的分布式计算计划,曾在2007年获吉尼斯世界纪录。

FAH在其官网上表示,2019-nCoV是SARS冠状病毒(SARS-CoV)的“近亲”,并且以类似的方式起作用。对于两种冠状病毒,当病毒表面的蛋白质与肺细胞上的受体蛋白质结合时,肺部感染就发生了。这种病毒蛋白称为刺突蛋白。由于蛋白质不会停滞,会摆动,折叠和以多种形状展开呈现,所以我们不仅需要研究病毒刺突蛋白的一种形状,还需要研究该蛋白摆动、折叠成其他形状的所有方式,以便更好地了解其与ACE2受体是如何相互作用的,从而可以开发出治疗抗体。了解这些信息,需要我们对2019-nCoV峰值蛋白的结构进行建模。我们需要构建可以实现此目标的计算模型,但它需要大量的计算能力。

FAH希望能利用志愿者闲置的中央处理器来构建计算能力。要参加新冠病毒项目,志愿者可以下载FAH软件,将自己计算机资源将发送到Folding@home,一起帮助纪念斯隆·凯特琳癌症中心的研究团队增进对2019-nCoV病毒的了解,设计出新疗法。

每部参与的电脑安装了后台运行的客户端程序后,在系统不忙碌时,可以调用中央处理器运行模拟工作。如今,世界上绝大部分的个人电脑,在一般的情况下都很少用尽本身的计算能力。Folding@home就是使用这些本来浪费了的运算力量。Folding@Home的客户端会定时连接设于斯坦福大学的服务器去获取“工作单元”(work units),即一种存有实验数据的数据包,根据实验数据进行计算。每个工作单元计算完成后,再传回服务器。

值得一提的是,FAH曾经使用闲置的Sony PlayStation 3s来帮助研究,而后者在处理FAH正在执行的特定任务时,其独特的“ Core”处理器在当时提供了比同类计算机更好的性能。不过索尼在2012年从PS3中删除了该功能。

此前Folding@home研究的项目还包括阿兹海默症、亨廷顿舞蹈症、牛海绵状脑病(疯牛病、疯牛病)、癌症和囊胞性纤维症。

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